RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464934.1

FANCD2-208, Transcript of FA complementation group D2, human

TSL 4

Gene FANCD2, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FANCD2-208	ENST00000464934	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934		A0A087WZ39	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934		A0A1W2PNV4	684 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934		A8MU76	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	EFNA2	O43921	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PROP1	O75360	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ZNF254	O75437	659 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CLPX	O76031	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	OR2F2	O95006	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TGM6	O95932	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	GSTA1	P08263	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CLTA	P09496	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CCNB1	P14635	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PTN	P21246	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MMP11	P24347	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	P2RY1	P47900	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RFX2	P48378	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	NDST2	P52849	883 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ATP1B3	P54709	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RIPK4	P57078	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PROK1	P58294	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	GK3P	Q14409	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	HAGH	Q16775	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	NRGN	Q92686	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FRG2C	A6NGY1	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MBTPS2	O43462	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CTSV	O60911	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	H6PD	O95479	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	YEATS4	O95619	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PMS2P2	O95744	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	MCF2	P10911	925 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PGC	P20142	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CERS1	P27544	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CRYBB2	P43320	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	NEDD4	P46934	1319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	BCAP31	P51572	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RAG2	P55895	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	DCDC1	P59894	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	PLP1	P60201	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RAB11A	P62491	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RIG	Q13278	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ILK	Q13418	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	CRMP1	Q14194	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	NFATC4	Q14934	902 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TAF13	Q15543	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	RAB11B	Q15907	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FANCD2-208	ENST00000464934	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms