RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CPEP16870 476 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FUT1P19526 365 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ETV5P41161 510 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ETV6P41212 452 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CRYBB2P43320 205 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ETV1P50549 477 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C21orf59P57076 290 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA1BP68363 451 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZXDAP98168 799 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FOXK2Q01167 660 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ACSM1Q08AH1 577 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 STX4Q12846 297 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC13A2Q13183 592 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TPBGQ13641 420 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CD226Q15762 336 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AMZ1Q400G9 498 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01559Q495D7 138 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PLK5Q496M5 336 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PERM1Q5SV97 790 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 VASNQ6EMK4 673 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TSSK4Q6SA08 328 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CASP12Q6UXS9 341 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 APOOLQ6UXV4 268 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZNX1 250 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA1AQ71U36 451 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC43A2Q8N370 569 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 STX19Q8N4C7 294 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC15A4Q8N697 577 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 PFN4Q8NHR9 129 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 FNDC8Q8TC99 324 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 LIPHQ8WWY8 451 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 BORCS5Q969J3 196 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf49Q96BT1 292 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD8Q96LT4 415 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SH3GL3Q99963 347 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CENPOQ9BU64 300 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT9Q9BW91 350 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HCAR1Q9BXC0 346 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR51E2Q9H255 320 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 OR52D1Q9H346 318 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SIAEQ9HAT2 523 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN10Q9HC96 672 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 Q9N2J8 555 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CMC2Q9NRP2 79 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SOHLH2Q9NX45 425 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CBLCQ9ULV8 474 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM5Q9Y2B1 443 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 TTC28Q96AY4 2481 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 USP34Q70CQ2 3546 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 GPR179Q6PRD1 2367 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WUJ7 227 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 C17orf105B2RV13 164 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 CCRL2O00421 344 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 AIREO43918 545 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRC-210ENST00000462363 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms