RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
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SMKR1-201ENST00000462322 PRKCAP17252 672 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SFTPDP35247 375 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FGFBP1Q14512 234 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 QPRTQ15274 297 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 HBMQ6B0K9 141 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 HMGN2P46Q86SG4 172 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ZG16BQ96DA0 208 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 STARD4Q96DR4 205 aa21.52■■□□□ 1.04
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SMKR1-201ENST00000462322 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.52■■□□□ 1.04
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SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.51■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 CAPN3P20807 821 aa21.51■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A8P48029 635 aa21.51■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 OSTF1Q92882 214 aa21.51■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF524Q96C55 264 aa21.51■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 A8MXE2 369 aa21.5■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 MSTNO14793 375 aa21.5■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.5■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 BTLAQ7Z6A9 289 aa21.5■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 FAM222BQ8WU58 562 aa21.5■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC25A53Q5H9E4 307 aa21.49■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 TMEM234Q8WY98 164 aa21.48■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 DSTNP60981 165 aa21.47■■□□□ 1.03
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SMKR1-201ENST00000462322 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 FAM214BQ7L5A3 538 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF563Q8TA94 476 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 PMM1Q92871 262 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 SPDL1Q96EA4 605 aa21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMKR1-201ENST00000462322 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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