RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNB4	P30926	498 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	GYS2	P54840	703 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CDK6	Q00534	326 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PMPCA	Q10713	525 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB2	Q16082	182 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTPA-222	ENST00000445241	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD1	O00168	92 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OIP5	O43482	229 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	IL2RA	P01589	272 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT7	P0C024	238 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PRKCA	P17252	672 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HTR3A	P46098	478 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MAP2K6	P52564	334 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NUP107	P57740	925 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SCARB2	Q14108	478 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	QPRT	Q15274	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ADRM1	Q16186	407 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	WNT2B	Q93097	391 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF175	Q9Y473	711 aa		13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241		H3BML4	177 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GMFG	O60234	142 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB7	O75635	380 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	DCTN3	O75935	186 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KRT34	O76011	436 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN14	O95500	239 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RNF224	P0DH78	156 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FCGR2A	P12318	317 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	COX4I1	P13073	169 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	STAR	P49675	285 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CCR4	P51679	360 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MTPN	P58546	118 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FOXF1	Q12946	379 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MAL2	Q969L2	176 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.18	□□□□□ -0.3

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