RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ELP5Q8TE02 316 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1F2PQ96R84 312 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MNTQ99583 582 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GAREM1Q9H706 876 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL1Q9NR64 748 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX4Q9UBX2 424 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL5CA6NH57 179 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 WRBO00258 174 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGER3P43115 390 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR5P85299 388 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EOGTQ5NDL2 527 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ACER2Q5QJU3 275 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST14Q8NCH0 376 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIB3Q96RU7 358 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT27Q9BW83 186 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BOCQ9BWV1 1114 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FN3KQ9H479 309 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SCML2Q9UQR0 700 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RCE1Q9Y256 329 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GWJ7 208 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM82A0PJX8 343 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2M5A3KFT3 312 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN3E7EW58 273 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CLN5O75503 358 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LY86O95711 162 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LRG1P02750 347 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRF1P14222 555 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ACHEP22303 614 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GDNFP39905 211 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TUSC3Q13454 348 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT2AQ92830 837 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GUH1 482 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR11A4FU01 709 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DRGXA6NNA5 263 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRODHO43272 600 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAF2O60831 178 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RAMP2O60895 175 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ICOSLGO75144 302 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RGRP47804 291 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC11A2P49281 568 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 STARP49675 285 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 METAP1P53582 386 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR1AP61163 376 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 STX4Q12846 297 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SMCO1Q147U7 214 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LNX2Q8N448 690 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SPICQ8N5J4 248 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CASD1Q96PB1 797 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PFDN5Q99471 154 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms