RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDB2Q92466 427 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCN3Q969E3 161 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2E3Q969T4 207 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB9Q96C00 473 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR34Q96EX3 536 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CMTM7Q96FZ5 175 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM237Q96Q45 408 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNA7Q96RP8 456 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASL10BQ96S79 203 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EBPLQ9BY08 206 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYRM4Q9HD34 91 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPG2Q9UBF2 871 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPB1Q9UBR1 384 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF11Q9UIL8 331 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCTPQ9UKL6 214 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDZD2O15018 2839 aa4.05□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0A6YYD5 115 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1B0GUH1 482 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASPDHA6ND91 283 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CGB1A6NKQ9 187 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C19orf84I3L1E1 186 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIPK2O43353 540 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP6AP2O75787 350 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F21O95013 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCELO95171 688 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLYCDO95822 493 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDYNP01213 254 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK1P06870 262 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT62P0C5K7 136 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCGR2AP12318 317 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5EP21589 574 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCAP28676 217 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB1P30740 379 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 BSGP35613 385 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGAP37287 484 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA5P43359 124 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA12P43365 314 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTNR1AP48039 350 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPC1P48995 793 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR6P50406 440 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ2P63252 427 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT88Q13099 833 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCN2Q14257 317 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 LTB4RQ15722 352 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52E8Q6IFG1 317 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR180Q86V85 440 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIAH3Q8IW03 269 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 GHDCQ8N2G8 530 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2M7Q8NG81 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10G3Q8NGC4 313 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF18AQ8NI77 898 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF721Q8TF20 911 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL29Q96CT2 875 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELP4Q96EB1 424 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPS2Q9BXY5 557 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 WWTR1Q9GZV5 400 aa4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms