RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-206ENST00000431413 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.53□□□□□ -0.24
HERC3-206ENST00000431413 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.52□□□□□ -0.24
HERC3-206ENST00000431413 OIP5O43482 229 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ITM2AO43736 263 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CYP7B1O75881 506 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 THBDP07204 575 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 YES1P07947 543 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 RAC3P60763 192 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 RPS26P62854 115 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 QPRTQ15274 297 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PDZK1Q5T2W1 519 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CROCCP2Q86T23 111 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 WFDC8Q8IUA0 241 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TUSC5Q8IXB3 177 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 LRRC34Q8IZ02 419 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ABHD3Q8WU67 409 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TMEM234Q8WY98 164 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R36Q96LQ0 422 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CENPHQ9H3R5 247 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 NGBQ9NPG2 151 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.52□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KLF4O43474 513 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 EFNA2O43921 213 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TMCC2O75069 709 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CSTAP01040 98 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PGCP20142 388 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 UQCRC2P22695 453 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 IL32P24001 234 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SHC1P29353 583 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SLC1A6P48664 564 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF844Q08AG5 666 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF141Q15928 474 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CLECL1Q8IZS7 167 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 MIPOL1Q8TD10 442 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TMEM171Q8WVE6 324 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ST8SIA1Q92185 356 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TESCQ96BS2 214 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 BDH2Q9BUT1 245 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 LAT2Q9GZY6 243 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KCNK9Q9NPC2 374 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 POLE3Q9NRF9 147 aa13.51□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 FCMRO60667 390 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 NTN1O95631 604 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 NID1P14543 1247 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 LBPP18428 481 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 HPCAP84074 193 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 P2RY6Q15077 328 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CLEC9AQ6UXN8 241 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 PERPQ96FX8 193 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 OR5B2Q96R09 309 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF350Q9GZX5 532 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 OR51I1Q9H343 314 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CXorf56Q9H5V9 222 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 MKLN1Q9UL63 735 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 UGT2B17O75795 530 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 GUSBP08236 651 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 DHRS4L1P0CG22 281 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 OR12D1P0DN82 309 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ENPP1P22413 925 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 KHKP50053 298 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 LTBQ06643 244 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 STX3Q13277 289 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 SKP2Q13309 424 aa13.49□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 CEP85LQ5SZL2 805 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms