RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 NBASA2RRP1 2371 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD42-202ENST00000393389 ARPC5O15511 151 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SCO1O75880 301 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ALDOBP05062 364 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IL12BP29460 328 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GJA4P35212 333 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KIR2DL3P43628 341 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 AGERQ15109 404 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CDK10Q15131 360 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 DUSP5Q16690 384 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 DCST2Q5T1A1 773 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 USP53Q70EK8 1073 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF547Q8IVP9 402 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RLN3Q8WXF3 142 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RAB7BQ96AH8 199 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR14A2Q96R54 314 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 APOOQ9BUR5 198 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FGF22Q9HCT0 170 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CLDND1Q9NY35 253 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CKLFQ9UBR5 152 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CDHR4A6H8M9 788 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 POM121BA6NF01 834 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SDC3O75056 442 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OPN1LWP04000 364 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF2F2P13984 249 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGS2P35354 604 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 EPHA5P54756 1037 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RPE65Q16518 533 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LAS2Q8IYD9 372 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF511Q8NB15 262 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 POT1Q9NUX5 634 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FZD7O75084 574 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TIMP1P01033 207 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MAKP20794 623 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 AKT2P31751 481 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CTXN1P60606 82 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FAPQ12884 760 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CDKN3Q16667 212 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC58Q4VC31 144 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KCTD9Q7L273 389 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC190Q86UF4 302 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RIT1Q92963 219 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 HYLS1Q96M11 299 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR92Q96MX6 357 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SRRQ9GZT4 340 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PRELID1Q9Y255 219 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PLXNB2O15031 1838 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RNF13O43567 381 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LGI1O95970 557 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PTHLHP12272 177 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NDUFS1P28331 727 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PTH2RP49190 550 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ARFIP1P53367 373 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FCRLAQ7L513 359 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT77Q7Z794 578 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR7G2Q8NG99 324 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SGTBQ96EQ0 304 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC35A4Q96G79 324 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NMNAT3Q96T66 252 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms