RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000386307.1

SNORD12C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12C, Length 89 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12C-201ENST00000386307 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 RFC2P35250 354 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 KRT20P35900 424 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MAGEA4P43358 317 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 UBE2AP49459 152 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TDGF1P3P51864 188 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CRISP1P54107 249 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 RPL8P62917 257 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 BDH1Q02338 343 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SLC39A6Q13433 755 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ARL6IP1Q15041 203 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 STK11Q15831 433 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF699Q32M78 642 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 BOLA3Q53S33 107 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CMPK2Q5EBM0 449 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 PVRIGQ6DKI7 326 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 FRMPD2BQ6IN97 320 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SYT10Q6XYQ8 523 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 GBP6Q6ZN66 633 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 Q6ZR03 302 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF621Q6ZSS3 439 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 NAT8LQ8N9F0 302 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 GATSQ8NAP1 163 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 LEMD2Q8NC56 503 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 Q8NFD4 153 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 NPBQ8NG41 125 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 OR51S1Q8NGJ8 323 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 OR10G9Q8NGN4 311 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 OR4A16Q8NH70 328 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM45BQ96B21 275 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ASB9Q96DX5 294 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CCDC51Q96ER9 411 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TVP23CQ96ET8 276 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MS4A14Q96JA4 679 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 BMFQ96LC9 184 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 COL21A1Q96P44 957 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 DEFB118Q96PH6 123 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TAAR1Q96RJ0 339 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM213AQ9BRX8 229 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 RNF126Q9BV68 326 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 AP1M1Q9BXS5 423 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 EDEM3Q9BZQ6 932 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SELENOIQ9C0D9 397 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ROGDIQ9GZN7 287 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ABCG4Q9H172 646 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 DEC1Q9P2X7 70 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 RIMS3Q9UJD0 308 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 A0A1B0GWB2 263 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 A0A1W2PP18 115 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TTC26A0AVF1 554 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP0.35□□□□□ -2.351e-323■■□□□ 12.1
SNORD12C-201ENST00000386307 UGT2B17O75795 530 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TNFSF13O75888 250 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 MPZL1O95297 269 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ADCY5O95622 1261 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 P0C880 135 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CHTF8P0CG12 524 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ALPPL2P10696 532 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 VCLP18206 1134 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CTNNB1P35222 781 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TNFSF9P41273 254 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 GYG1P46976 350 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 EFNB2P52799 333 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 CRISP3P54108 245 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 LIM2P55344 173 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 STX1BP61266 288 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 OSTNP61366 133 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SELENOTP62341 195 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ASIC1P78348 528 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ST3GAL3Q11203 375 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SMARCB1Q12824 385 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ZP4Q12836 540 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TFDP1Q14186 410 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM183BQ1AE95 376 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 EPC2Q52LR7 807 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD12C-201ENST00000386307 ATF7IP2Q5U623 682 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms