RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 BCHEP06276 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ACSM4P0C7M7 580 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LIMS3P0CW19 117 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LIMS4P0CW20 117 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HTR1FP30939 366 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CALCRP30988 508 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1E1P36543 226 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GAS1P54826 345 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CTBP2P56545 445 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LMAN2Q12907 356 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GSG1Q2KHT4 349 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MTSS1LQ765P7 747 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM25Q86YD3 366 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 YAF2Q8IY57 180 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ST8SIA4Q92187 359 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FGF11Q92914 225 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MED8Q96G25 268 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM14Q96QK8 99 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMED9Q9BVK6 235 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RERGLQ9H628 205 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MED11Q9P086 117 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GUH1 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 L7N2F9 121 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SYT5O00445 386 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF749O43361 778 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RNF13O43567 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF4O60810 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RP2O75695 350 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALNT1O75752 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SC5DO75845 299 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SOX30O94993 753 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF250P15622 560 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TYRP1P17643 537 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CD22P20273 847 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GMFBP60983 142 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NAE1Q13564 534 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DOC2BQ14184 412 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF385BQ569K4 471 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CT83Q5H943 113 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR6V1Q8N148 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FTMTQ8N4E7 242 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GPR156Q8NFN8 814 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A6Q92581 669 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MOAP1Q96BY2 351 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM19Q96HH6 336 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IFT46Q9NQC8 304 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.69□□□□□ -1.34
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