RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM114A2Q9NRY5 505 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PASKQ96RG2 1323 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTR3EA5X5Y0 456 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGK1O00141 431 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP9AO75110 1047 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 GLCEO94923 617 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 LALBAP00709 142 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 P04436 131 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF250P15622 560 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 STIP1P31948 543 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKCIP41743 596 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRKP42685 505 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACADSBP45954 432 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASMTP46597 345 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF83P51522 516 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERV-K104P63124 156 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKCDQ05655 676 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMARCB1Q12824 385 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLD1Q13393 1074 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IHHQ14623 411 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 KARSQ15046 597 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SS18Q15532 418 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF699Q32M78 642 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf100Q5SVJ3 147 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH8Q5T0T0 291 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATF7IP2Q5U623 682 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL23RQ5VWK5 629 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC70Q6NSX1 233 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM92BQ6ZTR7 304 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IFNEQ86WN2 208 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX32Q86XE0 403 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf19Q8IY42 314 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF679Q8IYX0 411 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNYQ8ND76 341 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNNM3Q8NE01 707 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5M1Q8NGP8 315 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FANK1Q8TC84 345 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 P3H4Q92791 437 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 RMDN1Q96DB5 314 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN18Q96SJ8 248 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMM29Q9BSF4 260 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 NLNQ9BYT8 704 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNTTIP1Q9H147 329 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 RETNQ9HD89 108 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TREM2Q9NZC2 230 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNRD1Q9P1U0 126 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF25Q9UIL4 384 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXL5Q9UKA1 691 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIGLEC7Q9Y286 467 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLLPQ9Y342 182 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRIN2DO15399 1336 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNS2Q63HR2 1409 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 DOCK8Q8NF50 2099 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GUL7 405 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM223A0PJW6 202 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLAC8L1A1L4L8 177 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDHAF1A6NFY7 115 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 A8MXE2 369 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BMH7 237 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2CO00762 179 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPIHO43447 177 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAD51DO75771 328 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADCY5O95622 1261 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 STARD3NLO95772 234 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNE2O96020 404 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADRB2P07550 413 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTA1P08263 222 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHX2P34913 555 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDI2P50395 445 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 STARD6P59095 220 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ESRRGP62508 458 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 TGFBR3Q03167 851 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF763Q0D2J5 394 aa-0.21□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms