RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACBD6Q9BR61 282 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCM2Q9BSQ5 444 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf50Q9BV19 199 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COLEC11Q9BWP8 271 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANO3Q9BYT9 981 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR2H1Q9GZK4 316 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDCL3Q9H2J4 239 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NELFAQ9H3P2 528 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF9Q9HAQ2 790 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACER3Q9NUN7 267 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OAZ3Q9UMX2 235 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOS1P29475 1434 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEG3Q9GZU2 1588 aa-4.16□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP152O94986 1710 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PPZ6 126 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLDN25C9JDP6 229 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F5H6K3 240 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIP1O00291 1037 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEX7O00628 323 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MCF2LO15068 1137 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACOX3O15254 700 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A20O43772 301 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAD21O60216 631 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIP5K1CO60331 668 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR1O75083 606 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPAG7O75391 227 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRAP2O75791 330 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGF18O76093 207 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNIH1O95406 144 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MBD3O95983 291 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADH1CP00326 375 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHRM2P08172 466 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFKMP08237 780 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EZRP15311 586 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NELFEP18615 380 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GABRA5P31644 462 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP12P39900 470 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ECE1P42892 770 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNJ1P48048 391 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL23P55773 120 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACTC1P68032 377 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLDN10P78369 228 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP8P85298 464 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLIN5Q00G26 463 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLRC3Q07444 240 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL13RA2Q14627 380 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNMTQ14749 295 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POSTNQ15063 836 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SURF1Q15526 300 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HYAL4Q2M3T9 481 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUBB8Q3ZCM7 444 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM78BQ5VT40 261 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC6A19Q695T7 634 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYB5R2Q6BCY4 276 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTL4Q6ZR62 310 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYFIP1Q7L576 1253 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BTLAQ7Z6A9 289 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF8Q7Z7C8 310 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM35AQ86V20 835 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIM3Q86V86 326 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TICAM2Q86XR7 235 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BAP18Q8IXM2 172 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM126BQ8IXS8 530 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TERB1Q8NA31 727 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR48Q8TAF3 677 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HELQQ8TDG4 1101 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 L3MBTL2Q969R5 705 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKR1E2Q96JD6 320 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIPEPQ99797 713 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHID1Q9BWS9 393 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF121Q9H920 327 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMLHEQ9NVH6 421 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAGE1Q9NXZ1 904 aa-4.17□□□□□ -3.08
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLK11Q9UBX7 282 aa-4.17□□□□□ -3.08
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