RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361927.8

COLGALT2-201, Transcript of collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COLGALT2, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT2-201ENST00000361927 TEX261Q6UWH6 196 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ZFP57Q9NU63 452 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 U3KQ87 197 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 LEFTY1O75610 366 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 GHSRQ92847 366 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 MROH6A6NGR9 719 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ACOD1A6NK06 481 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 PHYHO14832 338 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 P2RX6O15547 441 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ABHD4Q8TB40 342 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 TOMM40LQ969M1 308 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 NEIL2Q969S2 332 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 ELK1P19419 428 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 SERPINF1P36955 418 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 CCR9P51686 369 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 UBE2KP61086 200 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 TPGS2Q68CL5 300 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 XAF1Q6GPH4 301 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 NME7Q9Y5B8 376 aa14.9□□□□□ -0.02
COLGALT2-201ENST00000361927 TO15178 435 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 PTGER1P34995 402 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 CLDN20P56880 219 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SLC22A25Q6T423 547 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 MED20Q9H944 212 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HOXB5P09067 269 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 GABRB1P18505 474 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 MAOBP27338 520 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HCCSP53701 268 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 OR10K2Q6IF99 312 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 KDM8Q8N371 416 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 ANTXRLA6NF34 631 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 KIAA0355O15063 1070 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HCRTR2O43614 444 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 KIR2DL3P43628 341 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 NRG3P56975 720 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 TSPAN31Q12999 210 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 GAB1Q13480 694 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 LAS2Q8IYD9 372 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 OR14A2Q96R54 314 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SRRQ9GZT4 340 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 CIB4A0PJX0 185 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 FXYD1O00168 92 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 RDH16O75452 317 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 SPINT3P49223 89 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 DOK1Q99704 481 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 RLIMQ9NVW2 624 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.89□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 PPP1R2P9O14990 202 aa14.88□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HSD11B2P80365 405 aa14.88□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 LMAN2Q12907 356 aa14.88□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 DUSP7Q16829 419 aa14.88□□□□□ -0.03
COLGALT2-201ENST00000361927 HAS2Q92819 552 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms