RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CMC2Q9NRP2 79 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 V9GYH0 126 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HBQ1P09105 142 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ARSBP15848 533 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 EID2Q8N6I1 236 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MORN4Q8NDC4 146 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DIO2Q92813 273 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MED11Q9P086 117 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LINC01553A4QN01 128 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MCIDASD6RGH6 385 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SOCS6O14544 535 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PIP5K1CO60331 668 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NID1P14543 1247 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NPR2P20594 1047 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CXCR1P25024 350 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PGDP52209 483 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LTB4RQ15722 352 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SDF2Q99470 211 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FUZQ9BT04 418 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 FZD7O75084 574 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GKN3PP0CG01 181 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ITPKBP27987 946 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ART1P52961 327 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CAMK1Q14012 370 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RSC1A1Q92681 617 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NXPE2Q96DL1 559 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CMTM3Q96MX0 182 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A3Q99624 504 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GNB5O14775 395 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DNAJB6O75190 326 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NCR1O76036 304 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 C1QCP02747 245 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RLN1P04808 185 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC35E2P0CK97 266 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DNASE1P24855 282 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DNASE1L1P49184 302 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SERTAD2Q14140 314 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PARGQ86W56 976 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 GKN2Q86XP6 184 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CAPZA1P52907 286 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CAV3P56539 151 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 AGERQ15109 404 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RAB30Q15771 203 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PAQR7Q86WK9 346 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 LNX2Q8N448 690 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 OR4K13Q8NH42 304 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 DAPP1Q9UN19 280 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 MOKQ9UQ07 419 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 CDHR4A6H8M9 788 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-201ENST00000264345 A8MU76 341 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms