RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Csf2P01587 141 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Alox5P48999 674 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmp25Q3U435 615 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc35g3Q5F297 340 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xkr7Q5GH64 580 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Surf4Q64310 269 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sohlh1Q6IUP1 357 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ncr1Q8C567 325 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppwd1Q8CEC6 646 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il17rdQ8JZL1 738 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FevQ8QZW2 237 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TbccQ8VCN9 341 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr658Q8VGV5 323 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab40bQ8VHP8 278 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem63aQ91YT8 804 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a46Q9CQS4 418 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gnpda2Q9CRC9 276 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actl11Q9D5V1 1207 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ift43Q9DA69 206 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem38bQ9DAV9 292 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plekhb1Q9QYE9 243 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Brca2P97929 3329 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AgrnA2ASQ1 1950 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex28B1AYN9 409 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr592E9PYB3 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp2j8G3UZ38 503 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20696H3BJN7 74 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r86L7N213 316 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arl6O88848 186 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcpt2P15119 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdc25bP30306 576 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sf3b6P59708 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a3r1P70441 355 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcst1Q059Y8 732 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc30a1Q60738 503 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BocQ6AZB0 1110 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lamp3Q7TST5 411 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgat4bQ812F8 548 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a12Q8BH59 677 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cldn17Q8BXA6 224 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PigtQ8BXQ2 582 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ScaiQ8C8N2 606 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr108Q8VFA1 320 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr347Q8VGK2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr170Q8VGL6 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Frs3Q91WJ0 492 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndel1Q9ERR1 345 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chst11Q9JME2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrknQ9WVS6 464 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Parp4E9PYK3 1969 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex264E9Q137 309 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8882E9Q7E4 283 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21976J3QNN2 249 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cfl2P45591 166 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Six5P70178 719 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CpeQ00493 476 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Commd6Q3V4B5 87 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrsn2Q5HZK2 202 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf8Q60846 498 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mapk10Q61831 464 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Meig1Q61845 88 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rtp2Q80ZI2 223 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acp6Q8BP40 418 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fem1abQ8C0T1 654 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr157Q8C206 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata33Q8C624 132 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 St7lQ8K4P7 559 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr45Q91VM3 360 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhl22Q99JN2 634 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9CPZ3 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dhrs7Q9CXR1 338 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sesn3Q9CYP7 492 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Maf1Q9D0U6 258 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttyh1Q9D3A9 450 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a18Q9DB41 320 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3galt5Q9JI67 308 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim3Q9R1R2 744 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efemp2Q9WVJ9 443 aa9.5□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MpdzQ8VBX6 2055 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col12a1Q60847 3120 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcrg-V7A0A0A6YYE8 116 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A286YCH8 300 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A0A286YE43 300 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxw24E9PXM9 466 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm16506F7ANP4 213 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc16a5G5E8K6 468 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Msx1P13297 303 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HexaP29416 528 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxa10P31310 416 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Opn1swP51491 346 aa9.49□□□□□ -0.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf488Q5HZG9 337 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.8 ms