RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fmo2Q8K2I3 535 aa20.65■□□□□ 0.9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb16Q8VHS5 453 aa20.65■□□□□ 0.9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stx11Q9D3G5 287 aa20.65■□□□□ 0.9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inpp5eQ9JII1 647 aa20.65■□□□□ 0.9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm21731A0A286YDE9 180 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1338A2ACY7 313 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esp18A8R0V1 91 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr653E9PVA0 317 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C130060K24RikG3UWA8 416 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r117K7N6V1 857 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcp2P12660 120 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GhrP16882 650 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 EbpP70245 230 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cxcr5Q04683 374 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgtp2Q3T9E4 415 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rpa2Q62193 270 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgtp1Q62293 415 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc15a3Q8BPX9 578 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssuh2Q8C3L1 340 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ZxdcQ8C8V1 858 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpm8Q8R4D5 1104 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf130Q8VEM1 419 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdca3Q99M54 266 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FtmtQ9D5H4 237 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfsf13Q9D777 241 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AcoxlQ9DBS4 632 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plxdc2Q9DC11 530 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdh20Q9Z0M3 801 aa20.64■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tanc2A2A690 1994 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1200A2ATJ4 336 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xlr5aA2BI45 236 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10639E9Q6L7 222 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm21876F6XK35 94 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8922F6XVS9 199 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r29L7N2D4 852 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MscO88940 201 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gbx1P82976 418 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptchd3Q0EEE2 906 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt2Q3TTY5 707 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FuzQ3UYI6 415 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zrsr1Q64707 428 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gen1Q8BMI4 908 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem106aQ8VC04 261 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr45Q91VM3 360 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asb9Q91ZT8 290 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cers4Q9D6J1 393 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa20.63■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr310B2RVZ1 332 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8237E9Q257 205 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3629K7N6Y2 205 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wsb1O54927 421 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc25a35Q5SWT3 300 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam12Q61824 903 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DraxinQ6PAL1 343 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd3eapQ76KJ5 399 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slitrk5Q810B7 957 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc30a6Q8BJM5 460 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Derl2Q8BNI4 239 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scnm1Q8K136 229 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nsl1Q8K305 281 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sirt4Q8R216 333 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OgfrQ99PG2 633 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SyncQ9EPM5 470 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pole3Q9JKP7 145 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TinagQ9WUR0 475 aa20.62■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxw24E9PXM9 466 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacng1O70578 223 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camk2aP11798 478 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csf3rP40223 837 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St8sia5P70126 412 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cxcr4P70658 359 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HpcaP84075 193 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zglp1Q1WG82 266 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C1orf109Q499E6 217 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc5a6Q5U4D8 634 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tob1Q61471 362 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr406Q7TRX0 323 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc25Q810M4 279 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FarsaQ8C0C7 508 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Spata33Q8C624 132 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pom121Q8K3Z9 1200 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r212Q8R268 357 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1033Q8VFK5 310 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr51Q8VGG9 307 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il23aQ9EQ14 196 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Riox1Q9JJF3 603 aa20.61■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa20.6■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm14147A2AQX6 640 aa20.6■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm6337K7N6X9 211 aa20.6■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scarb2O35114 478 aa20.6■□□□□ 0.89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd40P27512 289 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.4 ms