RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA2P43356 314 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 KHKP50053 298 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM8P78325 824 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP4K2Q12851 820 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53BP2Q13625 1128 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 POMZP3Q6PJE2 187 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC20BQ86Y33 519 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 NAXEQ8NCW5 288 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP43Q8NFH3 380 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 CTHRC1Q96CG8 243 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf105B2RV13 164 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DL3P43628 341 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM107Q6UX40 140 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 LIPT1Q9Y234 373 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-216ENST00000628306 A6NNC1 897 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV3-11P04433 115 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 WLSQ5T9L3 541 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 OPN5Q6U736 354 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 PACRGLQ8N7B6 248 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO30Q8TB52 745 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 MAL2Q969L2 176 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 ACTRT3Q9BYD9 372 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.95■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 P04436 131 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf40Q8IXQ3 194 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7G2Q8NG99 324 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 DOHHQ9BU89 302 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51I1Q9H343 314 aa21.94■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf41Q9Y2V0 281 aa21.94■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 M0QX08 132 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 HRKO00198 91 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 NUBPLQ8TB37 319 aa21.93■■□□□ 1.1
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CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A15Q9H2J7 730 aa21.93■■□□□ 1.1
CAPNS1-216ENST00000628306 VCXQ9H320 206 aa21.93■■□□□ 1.1
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