RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C7orf72	A4D263	438 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DPRX	A6NFQ7	191 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PEX11A	O75192	247 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CYP7B1	O75881	506 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	LYZL6	O75951	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PRKD3	O94806	890 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	NGFR	P08138	427 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	LAMP1	P11279	417 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PAX1	P15863	534 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	KRT4	P19013	534 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PRPH2	P23942	346 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CRHR1	P34998	444 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	BSPH1	Q075Z2	132 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PDE7A	Q13946	482 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	NTM	Q9P121	344 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PP18	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078		H3BQF6	201 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OVOL3	O00110	214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PIP5K1B	O14986	540 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TBX19	O60806	448 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ADAM11	O75078	769 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C6orf47	O95873	294 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	YES1	P07947	543 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DANCR	P0C864	163 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	IDUA	P35475	653 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	P2RX1	P51575	399 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CCR4	P51679	360 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CASP9	P55211	416 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C21orf58	P58505	322 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PCLAF	Q15004	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HTRA1	Q92743	480 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	MECR	Q9BV79	373 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PIGU	Q9H490	435 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQD3	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CFLAR	O15519	480 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SOX30	O94993	753 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CHEK2	O96017	543 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	IFI6	P09912	130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PRKCA	P17252	672 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ADH6	P28332	368 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DMTN	Q08495	405 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PTGR1	Q14914	329 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PGGHG	Q32M88	737 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DCST2	Q5T1A1	773 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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