RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 GARNL3Q5VVW2 1013 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RPTNQ6XPR3 784 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GID4Q8IVV7 300 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TCTE3Q8IZS6 198 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SIGLEC7Q9Y286 467 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GVC2 190 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 A6NIN4 97 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TNFSF14O43557 240 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA8P32881 189 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 BTCP35070 178 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V1E1P36543 226 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MTNR1BP49286 362 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TFF2Q03403 129 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SNAP47Q5SQN1 464 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 IDNKQ5T6J7 187 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FIGNL1Q6PIW4 674 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MARVELD1Q9BSK0 173 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FN3KQ9H479 309 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ADGRL4Q9HBW9 690 aa12.37□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SMLR1H3BR10 107 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SC5DO75845 299 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF24P17028 368 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FOXK2Q01167 660 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GALEQ14376 348 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PLET1Q6UQ28 207 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CMC2Q9NRP2 79 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ACOXLQ9NUZ1 547 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 FLRT3Q9NZU0 649 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 EXTL2Q9UBQ6 330 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PHF11Q9UIL8 331 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 AGR2O95994 175 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PVRP15151 417 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GALK2Q01415 458 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 EIPR1Q53HC9 387 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 HBMQ6B0K9 141 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 WACQ9BTA9 647 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 GALNT9Q9HCQ5 603 aa12.36□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC72A6NJI9 287 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CYR61O00622 381 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 LINC01565O15544 149 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 HCRTR1O43613 425 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ATP1B1P05026 303 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL12Q53G59 568 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR10H4Q8NGA5 316 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR5W2Q8NH69 310 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PATE1Q8WXA2 126 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 HSD17B8Q92506 261 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CD180Q99467 661 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TEAD3Q99594 435 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 MAT2BQ9NZL9 334 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 B3GALT2O43825 422 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 PTP4A3O75365 173 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CTSBP07858 339 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 YES1P07947 543 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 EVI2BP34910 448 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1024LP59773 190 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 LIX1LQ8IVB5 337 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR5M3Q8NGP4 307 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 OR5J2Q8NH18 312 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 BPIFA2Q96DR5 249 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 BMFQ96LC9 184 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 TEX12Q9BXU0 123 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.35□□□□□ -0.43
C9orf170-201ENST00000623052 SATB2Q9UPW6 733 aa12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms