RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 HMGN4O00479 90 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 RFXANKO14593 260 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ADAMDEC1O15204 470 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 TNFSF13O75888 250 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ME2P23368 584 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 UQCRC1P31930 480 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 TLE4Q04727 773 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 SKP2Q13309 424 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 FGFBP1Q14512 234 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 GPR68Q15743 365 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 RNF130Q86XS8 419 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ZNF614Q8N883 585 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 POC1BQ8TC44 478 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 SMPDL3BQ92485 455 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 RAB8BQ92930 207 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 ADGRG7Q96K78 797 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 MKLN1Q9UL63 735 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 LIPT1Q9Y234 373 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-214ENST00000601319 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 FAM234BA2RU67 622 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 SASH3O75995 380 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 NTN1O95631 604 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PRKCAP17252 672 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CAPN3P20807 821 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PCYT1AP49585 367 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 IDH3AP50213 366 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CASP9P55211 416 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 STX1BP61266 288 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 HPCAP84074 193 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 FOXF1Q12946 379 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PON3Q15166 354 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 GUSBP1Q15486 140 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 KIF18BQ86Y91 864 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR5W2Q8NH69 310 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 GPR119Q8TDV5 335 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZFP90Q8TF47 636 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 FIG4Q92562 907 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PMM1Q92871 262 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ITCHQ96J02 903 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MAGEB18Q96M61 343 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF559Q9BR84 538 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 LAT2Q9GZY6 243 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 RMND5AQ9H871 391 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 TMEM45AQ9NWC5 275 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.45■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 KRT75O95678 551 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 NUDT14O95848 222 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CSTAP01040 98 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 C1QCP02747 245 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MYBPHQ13203 477 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CBFBQ13951 182 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR10D3Q8NH80 312 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 KLHL15Q96M94 604 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC6A13Q9NSD5 602 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 GJE1A6NN92 205 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MSTNO14793 375 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 H6PDO95479 791 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 GSNP06396 782 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 PGM1P36871 562 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 KIR2DL3P43628 341 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MVDP53602 400 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 AQP5P55064 265 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 MAPK14Q16539 360 aa15.43■□□□□ 0.06
HERC3-214ENST00000601319 SGCBQ16585 318 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms