RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CD5LO43866 347 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM11O75078 769 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKD3O94806 890 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPA8P0DM63 369 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP1P22413 925 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRPQ86YL5 185 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF524Q96C55 264 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GP6Q9HCN6 339 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RTTNQ86VV8 2226 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SONP18583 2426 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PLIN3O60664 434 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT14O95848 222 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 YES1P07947 543 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGADQ13349 1161 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY6Q15077 328 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MNS1Q8NEH6 495 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP90Q8TF47 636 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 STACQ99469 402 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 OXSMQ9NWU1 459 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CUBNO60494 3623 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GJE1A6NN92 205 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF212BA8MTL3 300 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RAMP1O60894 148 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA4LO95757 839 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CD8AP01732 235 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM153BP0C7A2 387 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX1P51575 399 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM153CQ494X1 144 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL26Q53HC5 615 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGUQ9H490 435 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS50Q9UI38 385 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CR1P17927 2039 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 AZIN1O14977 448 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LYZL6O75951 148 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00032P0C843 101 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCAP17252 672 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 EDNRAP25101 427 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC153Q494R4 210 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PHC2Q8IXK0 858 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PSD2Q9BQI7 771 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 BCO1Q9HAY6 547 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PNR3 127 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NEFHP12036 1026 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CPA3P15088 417 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1C1P21283 382 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MLC1Q15049 377 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 STK11Q15831 433 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC73Q6P1J9 531 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF165Q6ZSG1 346 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZT83 130 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC43A2Q8N370 569 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF527Q8NB42 609 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR119Q8TDV5 335 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HS6ST2Q96MM7 605 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE3Q9Y6H6 103 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA9B4DS77 424 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PTNP21246 168 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR3A2P47893 321 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 C21orf58P58505 322 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNTL6Q49A17 601 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DCST2Q5T1A1 773 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPMQ5VYY2 423 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KANK2Q63ZY3 851 aa22.7■■□□□ 1.22
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