RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 GIN1Q9NXP7 522 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 STOML1Q9UBI4 398 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ATRQ13535 2644 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PQD3 144 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 SCDO00767 359 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 NEFHP12036 1026 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 BCKDHAP12694 445 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ME2P23368 584 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ARRB2P32121 409 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 SERPINB4P48594 390 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 GALNTL6Q49A17 601 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 BEND4Q6ZU67 534 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 LILRA2Q8N149 483 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ZNF611Q8N823 705 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 TRMOQ9BU70 441 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 GLRX2Q9NS18 164 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 MID2Q9UJV3 735 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 KCNE3Q9Y6H6 103 aa10.78□□□□□ -0.68
CTIF-208ENST00000590422 PLCE1Q9P212 2302 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 PIP5K1BO14986 540 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 BPGMP07738 259 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 SOD3P08294 240 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 HPGDP15428 266 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ELK4P28324 431 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ATP5J2P56134 94 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CARD18P57730 90 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 TNK1Q13470 666 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 HHATQ5VTY9 493 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 STK32CQ86UX6 486 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 MISPQ8IVT2 679 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 TUSC5Q8IXB3 177 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 DDIASQ8IXT1 998 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 MGARPQ8TDB4 240 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 NEUROG1Q92886 237 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 BTBD2Q9BX70 525 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 GPR52Q9Y2T5 361 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 COL6A5A8TX70 2615 aa10.77□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 BIRC5O15392 142 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 TRIM13O60858 407 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 SOX30O94993 753 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 FGF4P08620 206 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 LAMP1P11279 417 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 EDNRAP25101 427 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ALDH3A1P30838 453 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 LCN1P31025 176 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 PTGR1Q14914 329 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 TAB1Q15750 504 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 KLHL26Q53HC5 615 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 XKR7Q5GH72 579 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CDC73Q6P1J9 531 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 FBXO27Q8NI29 283 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 AGR3Q8TD06 166 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 STACQ99469 402 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 MECRQ9BV79 373 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 OR10A4Q9H209 315 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 PIGUQ9H490 435 aa10.76□□□□□ -0.69
CTIF-208ENST00000590422 CXorf36Q9H7Y0 433 aa10.76□□□□□ -0.69
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