RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 RTL4Q6ZR62 310 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CDK20Q8IZL9 346 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ANKFN1Q8N957 763 aa6.73□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.73□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM210AQ96ND0 272 aa6.73□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 HPF1Q9NWY4 346 aa6.73□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 STMN3Q9NZ72 180 aa6.73□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 UGT2B17O75795 530 aa6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 ATP6V1G2O95670 118 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 ST3GAL3Q11203 375 aa6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 RCN1Q15293 331 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 COLEC12Q5KU26 742 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ACER2Q5QJU3 275 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 PIK3R3Q92569 461 aa6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 TAMM41Q96BW9 452 aa6.72□□□□□ -1.33
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SMAD4-210ENST00000590061 RDH12Q96NR8 316 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ADOQ96SZ5 270 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SEPHS2Q99611 448 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 EPYCQ99645 322 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 PIP5K1AQ99755 562 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 TEX12Q9BXU0 123 aa6.72□□□□□ -1.33
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