RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH3Q86UD3 253 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC1AQ8NC01 280 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR14Q9BWN1 585 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CTPS2Q9NRF8 586 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHAF3Q9NRP4 125 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TEKT2Q9UIF3 430 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK13Q9UKR3 277 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 DLGAP1O14490 977 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 LINGO3P0C6S8 592 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFBP5P24593 272 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 LAPTM4AQ15012 233 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 NHSL2Q5HYW2 709 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM156Q8N614 296 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 GATSQ8NAP1 163 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT4BQ9UQ53 548 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 CARD8Q9Y2G2 431 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 MED13Q9UHV7 2174 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0B4J2E0 115 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GX12 115 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNGR2P38484 337 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DAPP51397 102 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PODNL1Q6PEZ8 512 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ULK3Q6PHR2 472 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5M3Q8NGP4 307 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP4Q96JB8 637 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FEVQ99581 238 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 LHPPQ9H008 270 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF556Q9HAH1 456 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ENOPH1Q9UHY7 261 aa28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 HCRTR2O43614 444 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CHP2O43745 196 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM11O75078 769 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6B1O95007 311 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RX1P51575 399 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF117Q03924 483 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10G3Q8NGC4 313 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMF1Q92530 271 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SGCZQ96LD1 299 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENONQ9NZV5 590 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A7Q9UM01 511 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 NTNG1Q9Y2I2 539 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 AP4B1Q9Y6B7 739 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SCO2O43819 266 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAP00813 363 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT4P22083 530 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLP22681 906 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CLN3Q13286 438 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFAF6Q330K2 333 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ACER2Q5QJU3 275 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 WLSQ5T9L3 541 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 WBP2NLQ6ICG8 309 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CBLN3Q6UW01 205 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RRM2BQ7LG56 351 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 VASH2Q86V25 355 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 HS6ST2Q96MM7 605 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 RTN4RQ9BZR6 473 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL7AQ9H8H3 244 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT84Q9NSB2 600 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 HPF1Q9NWY4 346 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRF1Q9NZS2 232 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ICAM5Q9UMF0 924 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 POFUT2Q9Y2G5 429 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 LRCH1Q9Y2L9 728 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GWA3 101 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM10O14672 748 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10H3O60404 316 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 THY1P04216 161 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 PGCP20142 388 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MSX1P28360 303 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS1P54826 345 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX8P57073 446 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MERTKQ12866 999 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC23BQ15437 767 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 FCRLBQ6BAA4 426 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRSXQ8N5I4 330 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4K5Q8NGD3 323 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5W2Q8NH69 310 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSGQ96EG1 525 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP54Q96N23 3096 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 ADI1Q9BV57 179 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CPNE5Q9HCH3 593 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MPDZO75970 2070 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WUU8 490 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YAE9 185 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-206ENST00000588815 MASP2O00187 686 aa28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms