RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-DPB1P04440 258 aa15.24■□□□□ 0.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAM11O75078 769 aa15.22■□□□□ 0.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GABRA4P48169 554 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFX3P48380 749 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELOCQ15369 112 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8H2Q8N162 312 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF614Q8N883 585 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.22■□□□□ 0.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.22■□□□□ 0.03
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