RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SELENONQ9NZV5 590 aa26.76■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED31Q9Y3C7 131 aa26.76■■□□□ 1.88
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLCA1A8K7I4 914 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBL4AP11441 157 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR4P46093 362 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 COPZ1P61923 177 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALG10BQ5I7T1 473 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC27A4Q6P1M0 643 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSDL2Q6YN16 418 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLCO6A1Q86UG4 719 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR22Q8IZ63 422 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 APCDD1LQ8NCL9 501 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYDGFQ969H8 173 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRRG3Q9BZD7 231 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ULBP3Q9BZM4 244 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 EGLN3Q9H6Z9 239 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL20Q9NYY1 176 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDC14CA4D256 554 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 NGFRP08138 427 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ITIH1P19827 911 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBA3CQ13748 450 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 OMA1Q96E52 524 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDEM2Q9BV94 578 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 DSN1Q9H410 356 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM9BQ9NQ34 198 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 FKBP14Q9NWM8 211 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9J4A7 227 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 M0R129 80 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCMT1P22061 227 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRG3P56975 720 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB15P59190 212 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM201Q5SNT2 666 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 AHSA2Q719I0 299 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CADM2Q8N3J6 435 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUBPLQ8TB37 319 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MR1Q95460 341 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 COPS4Q9BT78 406 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF426Q9BUY5 554 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX12Q9BXU0 123 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PQD3 144 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBFA2T3O75081 653 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ICOSLGO75144 302 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFI30P13284 250 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCD3P28288 659 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTBP2P56545 445 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MVKQ03426 396 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRGPREQ86SM8 312 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8K3Q8NH51 312 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIGLEC11Q96RL6 698 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDC6Q99741 560 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TVP23BQ9NYZ1 205 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH10Q9Y6N8 788 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF264O43296 627 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCYT1AP49585 367 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD226Q15762 336 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFAF6Q330K2 333 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00114Q6XXX2 140 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF620Q6ZNG0 422 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 IQCF1Q8N6M8 205 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR13F1Q8NGS4 319 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 PFN4Q8NHR9 129 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 GGHQ92820 318 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 YIPF3Q9GZM5 350 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXorf56Q9H5V9 222 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNC119BA6NIH7 251 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MT-ND2P03891 347 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SKP2Q13309 424 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 OCLNQ16625 522 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A30Q5SVS4 291 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCAF12Q5T6F0 453 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSM5Q6NUN0 579 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIRREL2Q6UWL6 708 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MUL1Q969V5 352 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL4I1Q96RQ9 567 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHNO1Q9BSD3 238 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D23Q9NUY8 699 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOXL2Q9Y4K0 774 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC14L2O76054 403 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 MEDAGQ5VYS4 303 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM198BQ6UWH4 519 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 APOOLQ6UXV4 268 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM26EQ8N5C1 309 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCEANCQ8N8B7 351 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 GATSQ8NAP1 163 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUMF1Q8NBK3 374 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms