RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572253.5

CCDC40-207, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 3,962 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-207ENST00000572253 THBS2P35442 1172 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ERVK-21P61565 698 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TOR2AQ5JU69 321 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 FAM27D1Q5T7N8 215 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 IDO2Q6ZQW0 420 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR11H7Q8NGC8 314 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SLC6A20Q9NP91 592 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BRD7Q9NPI1 651 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 RABL2BQ9UNT1 228 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 A0A1W2PS29 197 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 I3L521 148 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 DBIP07108 87 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 THBS1P07996 1170 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 CEBPBP17676 345 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TEAD1P28347 426 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZNF81P51508 661 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 POU4F2Q12837 409 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HDDC3Q8N4P3 179 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR2L3Q8NG85 312 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MAP6Q96JE9 813 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TEAD3Q99594 435 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 KCNN3Q9UGI6 736 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HIDE1A8MVS5 230 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 PDGFAP04085 211 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MMP15P51511 669 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 FOXK2Q01167 660 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SNTA1Q13424 505 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TEX19Q8NA77 164 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR56B4Q8NH76 319 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SMPDL3BQ92485 455 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 NXPE2Q96DL1 559 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZNF681Q96N22 645 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TBX21Q9UL17 535 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 CDHR4A6H8M9 788 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 C4orf51C9J302 202 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MEN1O00255 615 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ITGA10O75578 1167 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 THY1P04216 161 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SBK2P0C263 348 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BTCP35070 178 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 E2F1Q01094 437 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 DUSP8Q13202 625 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 FGFBP1Q14512 234 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 RADILQ96JH8 1075 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 EMC3Q9P0I2 261 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 KLF15Q9UIH9 416 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 A0A1W2PRG6 482 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BHLHE40O14503 412 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ERVFC1P60507 584 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR1Q1Q15612 314 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MAPK14Q16539 360 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR7G2Q8NG99 324 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GHSRQ92847 366 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 HGDQ93099 445 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 YIPF5Q969M3 257 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 GIMAP5Q96F15 307 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 OR1A2Q9Y585 309 aa9.99□□□□□ -0.81
CCDC40-207ENST00000572253 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms