RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ERLIN1	O75477	346 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	STX11	O75558	287 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	RAF1	P04049	648 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	HRG	P04196	525 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	UBL4A	P11441	157 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	IL11	P20809	199 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	S100A3	P33764	101 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SFTPD	P35247	375 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT2B10	P36537	528 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC18A1	P54219	525 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CASP9	P55211	416 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PHC1	P78364	1004 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	KEAP1	Q14145	624 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CASP8	Q14790	479 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GUSBP1	Q15486	140 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ATG16L1	Q676U5	607 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD46	Q86W74	232 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5W2	Q8NH69	310 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MGARP	Q8TDB4	240 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR119	Q8TDV5	335 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ARL8A	Q96BM9	186 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MED18	Q9BUE0	208 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51I1	Q9H343	314 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	FANCF	Q9NPI8	374 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	8.42	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479		E9PBE3	544 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC3	O15379	428 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	UGT2B17	O75795	530 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP7B1	O75881	506 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	OR12D1	P0DN82	309 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	KIT	P10721	976 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKCA	P17252	672 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ELK4	P28324	431 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	NME5	P56597	212 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	UFM1	P61960	85 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXF1	Q12946	379 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CBFB	Q13951	182 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF141	Q15928	474 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SAXO2	Q658L1	398 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	OGFOD2	Q6N063	350 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB8B	Q92930	207 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MBD6	Q96DN6	1003 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSG	Q96EG1	525 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX37	Q96LM6	180 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	LAT2	Q9GZY6	243 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	MKLN1	Q9UL63	735 aa		8.41	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SDHD	O14521	159 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKD3	O94806	890 aa		8.4	□□□□□ -1.06
KIFC3-231	ENST00000567479	ATE1	O95260	518 aa		8.4	□□□□□ -1.06

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