RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NRM	Q8IXM6	262 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NDNF	Q8TB73	568 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	DGAT2	Q96PD7	388 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	LAMA5	O15230	3695 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CACNA1A	O00555	2505 aa		9.36	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279		H0YIG0	161 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SOX30	O94993	753 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	IGKV1D-16	P01601	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	GUSB	P08236	651 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	INHBB	P09529	407 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	GPR4	P46093	362 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SMS	P52788	366 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	EMP3	P54852	163 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	HSD17B7	P56937	341 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF91	Q05481	1191 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CRELD1	Q96HD1	420 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SEC16A	O15027	2179 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SDK2	Q58EX2	2172 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1B0GVG6	124 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	FMO6P	O60774	539 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CLPX	O76031	633 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	STAT5A	P42229	794 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RFX3	P48380	749 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	VBP1	P61758	197 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NCS1	P62166	190 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MC2R	Q01718	297 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	FUT7	Q11130	342 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	DOC2B	Q14184	412 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	OR1Q1	Q15612	314 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SYT14P1	Q58G82	188 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RRM2B	Q7LG56	351 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	KMT5C	Q86Y97	462 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CARF	Q8N187	725 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	OCEL1	Q9H607	264 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	LANCL2	Q9NS86	450 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CUTC	Q9NTM9	273 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RARRES3	Q9UL19	164 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		9.35	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PRAMEF2	O60811	474 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	OR2B3	O76000	313 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CLPS	P04118	112 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PTN	P21246	168 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	GCGR	P47871	477 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	TGIF1	Q15583	401 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		9.34	□□□□□ -0.91
TCF4-231	ENST00000566279	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91

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