RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFYCQ13952 458 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA21Q7Z572 469 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR119Q8TDV5 335 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZG16BQ96DA0 208 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM19Q96HH6 336 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF145Q96MT1 663 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIB1Q96RU8 372 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALHM2Q9HA72 323 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.03■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJA2O60884 412 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP7B1O75881 506 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUDT7P0C024 238 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPX2P18283 190 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ELK4P28324 431 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADH6P28332 368 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMP3P35625 211 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEC24CP53992 1094 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNJ10P78508 379 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXF1Q12946 379 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COQ5Q5HYK3 327 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UCN2Q96RP3 112 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CGREF1Q99674 301 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.02■□□□□ 0.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0G2JNJ9 132 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0G2JPF8 293 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLCA1A8K7I4 914 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC22O60826 627 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NID1P14543 1247 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL7RP16871 459 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKCAP17252 672 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POC1BQ8TC44 478 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMPDL3BQ92485 455 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q9UFV3 132 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCNX1Q96RV3 2341 aa20.01■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GMNCA6NCL1 334 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPB2A8KAH6 182 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C5orf58C9J3I9 102 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBP2O00757 339 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEC14L5O43304 696 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL2RAP01589 272 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARAFP10398 606 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PGCP20142 388 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ME2P23368 584 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GYS2P54840 703 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAC1P63000 192 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNGT1P63211 74 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 QPRTQ15274 297 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPB2Q16082 182 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIN52Q52LA3 116 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR52P1PQ8NH57 321 aa20■□□□□ 0.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BBS10Q8TAM1 723 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms