RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3D21	A4FU49	640 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJA2	O60884	412 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GOSR1	O95249	250 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NTN1	O95631	604 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GUSB	P08236	651 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ELK4	P28324	431 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	IL12A	P29459	219 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CPOX	P36551	454 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP9	P55211	416 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SIRPA	P78324	504 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	FGFBP1	Q14512	234 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	LILRA2	Q8N149	483 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NINJ1	Q92982	152 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSG	Q96EG1	525 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NEURL3	Q96EH8	262 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SERINC4	A6NH21	518 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF11	O14788	317 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL13	O43927	109 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	STX11	O75558	287 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2B17	O75795	530 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QC	P02747	245 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCA	P17252	672 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ME2	P23368	584 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SHC1	P29353	583 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A3	P33764	101 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	IST1	P53990	364 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NME5	P56597	212 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT5	Q11128	374 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ATG16L1	Q676U5	607 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO27	Q8NI29	283 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL15	Q96M94	604 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFHX3	Q15911	3703 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF264	O43296	627 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OR12D1	P0DN82	309 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CD79B	P40259	229 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SKP2	Q13309	424 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR68	Q15743	365 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MAVS	Q7Z434	540 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF614	Q8N883	585 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5W2	Q8NH69	310 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB8B	Q92930	207 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	EXD2	Q9NVH0	621 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MKLN1	Q9UL63	735 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200		C9JVG2	144 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF195	O14628	629 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF11	O14901	512 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0513	O60268	411 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT14	O95848	222 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	AGR2	O95994	175 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	HRG	P04196	525 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PGR	P06401	933 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	KIT	P10721	976 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	UBL4A	P11441	157 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CCKAR	P32238	428 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	HBM	Q6B0K9	141 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	OSTF1	Q92882	214 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAN	P16112	2415 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	UGT2B10	P36537	528 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ART1	P52961	327 aa		19.48	■□□□□ 0.71

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