RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	CASP9	P55211	416 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	C21orf58	P58505	322 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	HBA1	P69905	142 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF117	Q03924	483 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM27E3	Q08E93	113 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DCST2	Q5T1A1	773 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CPTP	Q5TA50	214 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CDC73	Q6P1J9	531 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CBLN3	Q6UW01	205 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SFXN5	Q8TD22	340 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	COQ8B	Q96D53	544 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LRRC46	Q96FV0	321 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PGM2	Q96G03	612 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RNF145	Q96MT1	663 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR7D2	Q96RA2	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	STAC	Q99469	402 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	BTBD2	Q9BX70	525 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PIGM	Q9H3S5	423 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PIGU	Q9H490	435 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	MED17	Q9NVC6	651 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB21	Q9UL25	225 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ACAN	P16112	2415 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A0J9YW62	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PQD3	144 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	C7orf72	A4D263	438 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFSF11	O14788	317 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ANKRD28	O15084	1053 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	EFNA2	O43921	213 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SCN2B	O60939	215 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ATE1	O95260	518 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SERPINE1	P05121	402 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	LINGO3	P0C6S8	592 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SOAT1	P35610	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PEX19	P40855	299 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC1A6	P48664	564 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CLDN8	P56748	225 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PHC1	P78364	1004 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	EMX2	Q04743	252 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FUT5	Q11128	374 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FOXF1	Q12946	379 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PGS1	Q32NB8	556 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF550	Q7Z398	422 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ANKRD46	Q86W74	232 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	KIF18B	Q86Y91	864 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10D3	Q8NH80	312 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NINJ1	Q92982	152 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	FOXC2	Q99958	501 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DUSP26	Q9BV47	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	NUF2	Q9BZD4	464 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	PNPO	Q9NVS9	261 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ASIC5	Q9NY37	505 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF175	Q9Y473	711 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304	ZAN	Q9Y493	2812 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A087WZY1	265 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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