RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 ZNF117Q03924 483 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CD226Q15762 336 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 BEND4Q6ZU67 534 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB18Q99592 522 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NMUR2Q9GZQ4 415 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.17■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF195O14628 629 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CYP7B1O75881 506 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 LINGO3P0C6S8 592 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NPIPA8P0DM63 369 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 S100A3P33764 101 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 FOXF1Q12946 379 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 GPR68Q15743 365 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ATG16L1Q676U5 607 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 OR5D16Q8NGK9 328 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 OR5W2Q8NH69 310 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 FBXO27Q8NI29 283 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM234Q8WY98 164 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TESCQ96BS2 214 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SDF2Q99470 211 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NUF2Q9BZD4 464 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.16■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 A0A0J9YW62 118 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CGAP01215 116 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 IL11P20809 199 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 FPR1P21462 350 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CRYGSP22914 178 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SLC6A8P48029 635 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 KHKP50053 298 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SELENBP1Q13228 472 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SLC43A2Q8N370 569 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 GPR119Q8TDV5 335 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ADGRG7Q96K78 797 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 POLE3Q9NRF9 147 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 THAP1Q9NVV9 213 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 HAO1Q9UJM8 370 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 ICAM5Q9UMF0 924 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 KCNE3Q9Y6H6 103 aa15.15■□□□□ 0.02
CASP9-211ENST00000546969 SERINC4A6NH21 518 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 ESPNB1AK53 854 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 ARHGEF9O43307 516 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 ATE1O95260 518 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 CSTAP01040 98 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 PGCP20142 388 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 BST1Q10588 318 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 GUSBP1Q15486 140 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 CBLN3Q6UW01 205 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD46Q86W74 232 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 POC1BQ8TC44 478 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 NUDT8Q8WV74 236 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 PIGTQ969N2 578 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 ARSGQ96EG1 525 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 SORT1Q99523 831 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 LAT2Q9GZY6 243 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 OR51I1Q9H343 314 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 GP6Q9HCN6 339 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.14■□□□□ 0.01
CASP9-211ENST00000546969 WDR45Q9Y484 360 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms