RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546411.6

CUX1-211, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-211ENST00000546411 GPX5O75715 221 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 AK1P00568 194 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SAXO2Q658L1 398 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 BEST4Q8NFU0 473 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ICKQ9UPZ9 632 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SCG5P05408 212 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 DRD1P21728 446 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PKLRP30613 574 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ACTC1P68032 377 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ACTA1P68133 377 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 FAHD1Q6P587 224 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 RTL10Q7L3V2 364 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ZG16BQ96DA0 208 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MROQ9BYG7 248 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.62□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 GABRPO00591 440 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 NPC1O15118 1278 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PPM1BO75688 479 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TEAD1P28347 426 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 KCNJ8Q15842 424 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LACC1Q8IV20 430 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 EXO5Q9H790 373 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LINC01565O15544 149 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ETV5P41161 510 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ETV1P50549 477 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TANKQ92844 425 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 H7C1C5 153 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SLC19A2O60779 497 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LCN6P62502 163 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CHAF1BQ13112 559 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 GRM7Q14831 915 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 XKRXQ6PP77 449 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 OR7G2Q8NG99 324 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SFXN5Q8TD22 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 RNF121Q9H920 327 aa14.61□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 AQP9O43315 295 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PRAMEF2O60811 474 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 VAMP1P23763 118 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SHC1P29353 583 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PDE7AQ13946 482 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 UBQLN3Q9H347 655 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 HYKKA2RU49 373 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CDKN3Q16667 212 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 RSC1A1Q92681 617 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SLC35A4Q96G79 324 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 HHATLQ9HCP6 504 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 LGI1O95970 557 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CSRP3P50461 194 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CLDN12P56749 244 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 PFN4Q8NHR9 129 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MAP3K3Q99759 626 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CHST8Q9H2A9 424 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 FN3KQ9H479 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 SCML1Q9UN30 329 aa14.6□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 H3BML4 177 aa14.59□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MAN2B1O00754 1011 aa14.59□□□□□ -0.07
CUX1-211ENST00000546411 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms