RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 NCSTNQ92542 709 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 RAB8BQ92930 207 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 TMEM19Q96HH6 336 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 EPYCQ99645 322 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 OR51I1Q9H343 314 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 POT1Q9NUX5 634 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.04□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 COL4A2P08572 1712 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 A0A0J9YY10 115 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 C2orf74A8MZ97 194 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 H0YGG7 62 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 C9P02748 559 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 CSF2P04141 144 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 MATN1P21941 496 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 CRHBPP24387 322 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 RRM2P31350 389 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 PTGER1P34995 402 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 OR1E2P47887 323 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 PPP1CAP62136 330 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 HSPB3Q12988 150 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 SYPL1Q16563 259 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 RFX4Q33E94 735 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 ZNF691Q5VV52 312 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 TMEM64Q6YI46 380 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 SMYD1Q8NB12 490 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 BBS4Q96RK4 519 aa5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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TRDN-205ENST00000546248 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.03□□□□□ -1.6
TRDN-205ENST00000546248 REEP1Q9H902 201 aa5.03□□□□□ -1.6
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