RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLON5	A6NGN9	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308		K7EQG2	157 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PDLIM1	O00151	329 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NR5A2	O00482	541 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR9G9	P0C7N8	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CFC1	P0CG37	223 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCRB	P14927	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5E	P21589	574 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL23	P55773	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CBX1	P83916	185 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MECOM	Q03112	1051 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF85	Q03923	595 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CD226	Q15762	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PARG	Q86W56	976 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NANP	Q8TBE9	248 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ART4	Q93070	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UPRT	Q96BW1	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BIRC7	Q96CA5	298 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	WBP1	Q96G27	269 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CNDP1	Q96KN2	507 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SENP8	Q96LD8	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	PARL	Q9H300	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	VCX2	Q9H322	139 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DEPP	Q9NTK1	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	THYN1	Q9P016	225 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	COX16	Q9P0S2	106 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM3AP	O60318	1980 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GSAP	A4D1B5	854 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UBXN8	O00124	270 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN5	O00501	218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSCAN12	O43309	604 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX1	O43812	170 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EFNA2	O43921	213 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SNAP91	O60641	907 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	CNMD	O75829	334 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FLOT1	O75955	427 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RHOBTB1	O94844	696 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHG3	P01860	377 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ADORA3	P0DMS8	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BRCC3	P46736	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	POU3F4	P49335	361 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	BOLA3	Q53S33	107 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RLN3	Q8WXF3	142 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT15	Q9BQS2	421 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	GON7	Q9BXV9	100 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF6	Q9Y252	685 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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