RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 FZD3Q9NPG1 666 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TREM2Q9NZC2 230 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.23□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CPED1A4D0V7 1026 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 A6NIZ1 184 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PHYHO14832 338 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 SERPINA3P01011 423 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 NR3C1P04150 777 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 IMPDH1P20839 514 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TNFRSF8P28908 595 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 MPIP34949 423 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 GNPDA1P46926 289 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 GCLMP48507 274 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ALDH9A1P49189 494 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 VAMP7P51809 220 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CLDN2P57739 230 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 DAOAP59103 153 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 GNG11P61952 73 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 DLG1Q12959 904 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ZNF273Q14593 569 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TGIF1Q15583 401 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ZNF284Q2VY69 593 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 KLK6Q92876 244 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 C10orf90Q96M02 699 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 RNF145Q96MT1 663 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ZNF559Q9BR84 538 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TMED9Q9BVK6 235 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 MAGEF1Q9HAY2 307 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 NANSQ9NR45 359 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 CISHQ9NSE2 258 aa7.22□□□□□ -1.25
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LMO3-212ENST00000535535 POT1Q9NUX5 634 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 TMEM160Q9NX00 188 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 ALG5Q9Y673 324 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 AUP1Q9Y679 476 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 U3KQV3 271 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-212ENST00000535535 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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LMO3-212ENST00000535535 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 PDXKO00764 312 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TUSC2O75896 110 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MATN4O95460 622 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CH25HO95992 272 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TGFAP01135 160 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 IGLV2-14P01704 120 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TRIM49P0CI25 452 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 TRIM49CP0CI26 452 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 LIPCP11150 499 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CDH1P12830 882 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NR2C1P13056 603 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SRMP19623 302 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MAGP20916 626 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 AKT2P31751 481 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CCR7P32248 378 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MC5RP33032 325 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 CAPZBP47756 277 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NUMBP49757 651 aa7.21□□□□□ -1.26
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LMO3-212ENST00000535535 MAP2K6P52564 334 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 EMP2P54851 167 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MLLT10P55197 1068 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 NOMO3P69849 1222 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 SPOCK1Q08629 439 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MADCAM1Q13477 382 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 MED21Q13503 144 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-212ENST00000535535 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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