RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NOS1	P29475	1434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	AQP9	O43315	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PFKFB2	O60825	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR3C1	P04150	777 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GP1BA	P07359	652 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ELANE	P08246	267 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CT62	P0C5K7	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRF1	P14222	555 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PSMB5	P28074	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KRT81	Q14533	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ERVK-7	P63135	1459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		A0A1W2PPV9	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		A8MX80	341 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967		E7EWF7	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR7A17	O14581	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	FCN3	O75636	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	STK17B	O94768	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR2C1	P13056	603 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TBXA2R	P21731	343 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HPCAL1	P37235	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAGEA6	P43360	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RFX3	P48380	749 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NFYC	Q13952	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR4A3	Q92570	626 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	LHPP	Q9H008	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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