RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF527Q8NB42 609 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FBXO27Q8NI29 283 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GPR119Q8TDV5 335 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ADGRG7Q96K78 797 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RUBCNLQ9H714 662 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 TCF7L2Q9NQB0 619 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 JKAMPQ9P055 326 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.86■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MPDZO75970 2070 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 A0A087WZY1 265 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 DUXAA6NLW8 204 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RFXANKO14593 260 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CXCL13O43927 109 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 H6PDO95479 791 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MYBPHQ13203 477 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GPAT3Q53EU6 434 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 MIER2Q8N344 545 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OR10D3Q8NH80 312 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZFP90Q8TF47 636 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB8AQ96BR9 441 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C14orf79Q96F83 325 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 EXD2Q9NVH0 621 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 WDR45Q9Y484 360 aa16.85■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CSMD1Q96PZ7 3565 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 C7orf72A4D263 438 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SYT5O00445 386 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF264O43296 627 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ADAM11O75078 769 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 AK1P00568 194 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 PRKCAP17252 672 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SSTR2P30874 369 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 OPRM1P35372 400 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 QPRTQ15274 297 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 NRGNQ92686 78 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SFXN3Q9BWM7 321 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 GALNT8Q9NY28 637 aa16.84■□□□□ 0.29
TSTA3-211ENST00000529899 FAM234BA2RU67 622 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 H3BNH8 94 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 NR5A2O00482 541 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 IL18BPO95998 194 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CSTAP01040 98 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 IL6P05231 212 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ETFAP13804 333 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 KLK2P20151 261 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FGFBP1Q14512 234 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SGCBQ16585 318 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OR5W2Q8NH69 310 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LINC01560Q8TB33 94 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 STARD4Q96DR4 205 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MAGEB18Q96M61 343 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF559Q9BR84 538 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.83■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 TACC2O95359 2948 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LINC01387J3KSC0 135 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 NTN1O95631 604 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CAPN3P20807 821 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 PGM1P36871 562 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 RAC1P63000 192 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 24.7
TSTA3-211ENST00000529899 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 LILRA2Q8N149 483 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TSTA3-211ENST00000529899 GTF2H4Q92759 462 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms