RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF550	Q7Z398	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TANK	Q92844	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RIT1	Q92963	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	UCN3	Q969E3	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PRR25	Q96S07	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	AP4M1	O00189	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLOD2	O00469	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	EMC8	O43402	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ICOSLG	O75144	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CBR3	O75828	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GPR75	O95800	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TTC4	O95801	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	AIFM1	O95831	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PLAU	P00749	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	KRT14	P02533	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CHRM2	P08172	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	POU2F1	P14859	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ABCD3	P28288	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GRK5	P34947	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	STAR	P49675	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TPTE	P56180	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CLDN15	P56746	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SNTA1	Q13424	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GPR180	Q86V85	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBR5-208	ENST00000520898	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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