RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NPAS1	Q99742	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DSN1	Q9H410	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MED11	Q9P086	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MANBA	O00462	879 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	STX16	O14662	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EMC8	O43402	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SMIM24	O75264	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ESRRB	O95718	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CRH	P06850	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PEPD	P12955	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FPR1	P21462	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RFX3	P48380	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DGCR2	P98153	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSG6	Q00889	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TNK1	Q13470	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EFR3A	Q14156	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	APIP	Q96GX9	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FADS1	O60427	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SOX30	O94993	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSMG1	O95456	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OTC	P00480	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OPN1LW	P04000	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SDHA	P31040	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT20	P35900	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CAV1	Q03135	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	VEZF1	Q14119	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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