RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	STON2	Q8WXE9	905 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	FIG4	Q92562	907 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	MED17	Q9NVC6	651 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC22A3	O75751	556 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SYNGR4	O95473	234 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	HRG	P04196	525 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	POU2F1	P14859	743 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP3CB	P16298	524 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	IL11	P20809	199 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	P2RX1	P51575	399 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP12A	P54707	1039 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CTBP2	P56545	445 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	KEAP1	Q14145	624 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	KLHL26	Q53HC5	615 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	DCST2	Q5T1A1	773 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CDS1	Q92903	461 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBTB18	Q99592	522 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	C16orf97	H3BN30	126 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CGA	P01215	116 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GUSB	P08236	651 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CDKN2C	P42773	168 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNJ5	P48544	419 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	VWA1	Q6PCB0	445 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	MIER2	Q8N344	545 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	NRGN	Q92686	78 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	KLHL15	Q96M94	604 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR52E6	Q96RD3	313 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464		H0YC42	278 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	GMFG	O60234	142 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	STX11	O75558	287 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	ATE1	O95260	518 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ABCC3-208	ENST00000506464	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65

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