RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 UTF1Q5T230 341 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 XYLT1Q86Y38 959 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 APCDD1Q8J025 514 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 STPG2Q8N412 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMBIM1Q969X1 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 Q96MT0 163 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MICU1Q9BPX6 476 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ING2Q9H160 280 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL31Q9H511 634 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ALG6Q9Y672 507 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CLIC4Q9Y696 253 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATP10DQ9P241 1426 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 E9PLN8 166 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB7O75635 380 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TNFAIP8O95379 198 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 UTS2O95399 124 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 EGFP01133 1207 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCRBP04435 133 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 UQCRBP14927 111 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CYP11B1P15538 503 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NMBRP28336 390 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CALCRP30988 508 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RCVRNP35243 200 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PPOXP50336 477 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G16P53816 162 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATP1B3P54709 279 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BLOC1S1P78537 153 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AESQ08117 197 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SLC39A6Q13433 755 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 GK3PQ14409 553 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MELKQ14680 651 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PTGISQ16647 500 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 AHSA2Q719I0 299 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 LYG2Q86SG7 212 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TDHQ8IZJ6 230 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 PARP8Q8N3A8 854 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FITM2Q8N6M3 262 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 COQ8AQ8NI60 647 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TCEAL3Q969E4 200 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 MYLPFQ96A32 169 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NXPE2Q96DL1 559 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 FAM210BQ96KR6 192 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB12Q96P63 405 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 TSSK2Q96PF2 358 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.65□□□□□ -1.34
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