RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TOR3AQ9H497 397 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 KLK13Q9UKR3 277 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.61□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 A0A1B0GWA3 101 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FAAHO00519 579 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SCDO00767 359 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 HS6ST1O60243 411 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ITGA10O75578 1167 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CCNB2O95067 398 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CLIC3O95833 236 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ANGPTL1O95841 491 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CSTAP01040 98 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SERPINA7P05543 415 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 THRBP10828 461 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 LIPCP11150 499 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SOX3P41225 446 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DLX5P56178 289 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NRG3P56975 720 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TAS2R41P59536 307 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF117Q03924 483 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ST3GAL3Q11203 375 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CLN3Q13286 438 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 KCNAB2Q13303 367 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 EFR3AQ14156 821 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF613Q6PF04 617 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF550Q7Z398 422 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OR5M3Q8NGP4 307 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TTC9Q92623 222 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF559Q9BR84 538 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ADAM19Q9H013 955 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 LAMA5O15230 3695 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 H0YAE9 185 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SLC16A6O15403 523 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF264O43296 627 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PIP5K1CO60331 668 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 UBL4AP11441 157 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ICAM2P13598 275 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ANXA8P13928 327 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SPINK2P20155 84 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CAPGP40121 348 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CASP3P42574 277 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GSSP48637 474 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ARHGDIAP52565 204 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 UGT2B15P54855 530 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 SMIM11AP58511 58 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TRAM2Q15035 370 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DCAF10Q5QP82 559 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 VASH2Q86V25 355 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF527Q8NB42 609 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 NR4A3Q92570 626 aa8.59□□□□□ -1.03
SEC22C-216ENST00000493107 GATA6Q92908 595 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms