RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COPS3Q9UNS2 423 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAC2P15153 192 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AHRP35869 848 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP22Q9UPT9 525 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.13■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXNL1O43396 289 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNG3O60359 315 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GMDSO60547 372 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLE3Q04726 772 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEF2DQ14814 521 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APOOLQ6UXV4 268 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4D6Q8NGJ1 314 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FNDC9Q8TBE3 224 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDS1Q92903 461 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HINT2Q9BX68 163 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0U1RQK1 487 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANTXRLA6NF34 631 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MROH6A6NGR9 719 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLX5P56178 289 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BEX5Q5H9J7 111 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCTLQ6UWM7 567 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGCZQ96LD1 299 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APBB3O95704 486 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNMTP11086 282 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRABP1P29762 137 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBE2NLQ5JXB2 153 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCN10Q6JVE6 187 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF100Q8IYN0 542 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUMF2Q8NBJ7 301 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1S1Q8NH92 325 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS21Q9Y6M0 314 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EGFP01133 1207 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYPD4Q6UWN0 246 aa16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A8MVJ9 347 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGM5O43548 720 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLC1Q15049 377 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PEA15Q15121 130 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD163Q86VB7 1156 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYH11P35749 1972 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OIP5O43482 229 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DMAP28067 261 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCD5Q86SK9 330 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LILRA2Q8N149 483 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR26Q8NDV2 337 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HRH4Q9H3N8 390 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RCE1Q9Y256 329 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM183AA6NL82 134 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC14L5O43304 696 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPIN2AQ99865 258 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52D1Q9H346 318 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POU2F3Q9UKI9 436 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAPP51397 102 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ECH1Q13011 328 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms