RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	HCFC1	P51610	2035 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB14	O43829	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	DPM1	O60762	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KERA	O60938	352 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZFAND5	O76080	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PGLS	O95336	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SOD1	P00441	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CSN3	P07498	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TCF4	P15884	667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SYT1	P21579	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MPZ	P25189	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ACADSB	P45954	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SULT1E1	P49888	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	BPIFB3	P59826	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CUL3	Q13618	768 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CYTH1	Q15438	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TAZ	Q16635	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UGP2	Q16851	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NSMAF	Q92636	917 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NRGN	Q92686	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PGRMC2	O15173	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	INPP4B	O15327	924 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HSF2BP	O75031	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ALOX12B	O75342	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ACSL3	O95573	720 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC2A3	P11169	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CDH3	P22223	829 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HTR1E	P28566	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PTPN4	P29074	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SLC6A12	P48065	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	UBASH3A	P57075	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KCNK10	P57789	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RHOA	P61586	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TNK1	Q13470	666 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM17-208	ENST00000467080	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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