RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CENPHQ9H3R5 247 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 EXD2Q9NVH0 621 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 CARD8Q9Y2G2 431 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRF-210ENST00000463041 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SERINC4A6NH21 518 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TNFSF11O14788 317 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF264O43296 627 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 EFNA2O43921 213 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SCN2BO60939 215 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ATE1O95260 518 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NUDT14O95848 222 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OPN1LWP04000 364 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PPP3CBP16298 524 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BGNP21810 368 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CRYGSP22914 178 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ELK4P28324 431 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 S100A3P33764 101 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CPOXP36551 454 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A8P48029 635 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC18A1P54219 525 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PHC1P78364 1004 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF117Q03924 483 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CASP8Q14790 479 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF141Q15928 474 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HHATQ5VTY9 493 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OGFOD2Q6N063 350 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CBLN3Q6UW01 205 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BEND4Q6ZU67 534 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 STK32CQ86UX6 486 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC43A2Q8N370 569 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO27Q8NI29 283 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL15Q96M94 604 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NPAS1Q99742 590 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MED18Q9BUE0 208 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 LAT2Q9GZY6 243 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR10A4Q9H209 315 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GP6Q9HCN6 339 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 POLE3Q9NRF9 147 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PNPOQ9NVS9 261 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 THAP1Q9NVV9 213 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 USF3Q68DE3 2245 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ESPNB1AK53 854 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD28O15084 1053 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OIP5O43482 229 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FCMRO60667 390 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 DNAJA2O60884 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PRKD3O94806 890 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NTN1O95631 604 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NPIPA8P0DM63 369 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 UBL4AP11441 157 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NID1P14543 1247 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FOSL1P15407 271 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PRKCAP17252 672 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CD53P19397 219 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLK2P20151 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SFTPDP35247 375 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SOAT1P35610 550 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RAC3P60763 192 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PPP2R2AP63151 447 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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