RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 TM9SF2Q99805 663 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CALHM2Q9HA72 323 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MED17Q9NVC6 651 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 VAPAQ9P0L0 249 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ARMCX1Q9P291 453 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.67□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NCKAP5O14513 1909 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 AGAP5A6NIR3 686 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SLC22A20A6NK97 555 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 C17orf51A8MQB3 221 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 DVL2O14641 736 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 AIM2O14862 343 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 GSTA4O15217 222 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 GMNNO75496 209 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 DCTN3O75935 186 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CLDN14O95500 239 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 EPPINO95925 133 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 OPN1LWP04000 364 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CHRM4P08173 479 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TFPTP0C1Z6 253 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 GLI4P10075 376 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ZNF17P17021 662 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 AGAP20933 346 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SFTPDP35247 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 HTR3AP46098 478 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CARD18P57730 90 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NUP107P57740 925 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NCALDP61601 193 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MXRA7P84157 204 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MERTKQ12866 999 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SCARB2Q14108 478 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FGFBP1Q14512 234 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 QPRTQ15274 297 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CD226Q15762 336 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 OR2A2Q6IF42 318 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ZNF550Q7Z398 422 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 LILRA2Q8N149 483 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 DPP10Q8N608 796 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FBXO27Q8NI29 283 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NFKBIDQ8NI38 313 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 RNF138Q8WVD3 245 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 C10orf82Q8WW14 230 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ST8SIA1Q92185 356 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MAL2Q969L2 176 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 LRRC58Q96CX6 371 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PIF1Q9H611 641 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CHST11Q9NPF2 352 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.66□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CFAP73A6NFT4 308 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CD8B2A6NJW9 211 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CLCA1A8K7I4 914 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NDUFAB1O14561 156 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PGM3O95394 542 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 IFNA14P01570 189 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FCGR2AP12318 317 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 COX4I1P13073 169 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 NID1P14543 1247 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CCNA2P20248 432 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 CXCR1P25024 350 aa8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKP4-208ENST00000462335 ADH6P28332 368 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms