RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 POLE3Q9NRF9 147 aa21.57■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 JKAMPQ9P055 326 aa21.57■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF175Q9Y473 711 aa21.57■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 POLQO75417 2590 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PNV4 684 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 HMGN4O00479 90 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0513O60268 411 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 UGT2B17O75795 530 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CYP7B1O75881 506 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SASH3O75995 380 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CRHP06850 196 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 KIR2DL3P43628 341 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 IDH3AP50213 366 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CCR4P51679 360 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 STX1BP61266 288 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 HPCAP84074 193 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FUT5Q11128 374 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FOXF1Q12946 379 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 GPAT3Q53EU6 434 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 OR5W2Q8NH69 310 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 GPR119Q8TDV5 335 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PIGMQ9H3S5 423 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 RMND5AQ9H871 391 aa21.56■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ANP32DO95626 131 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 KRT75O95678 551 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CSTAP01040 98 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 GUSBP08236 651 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CPA2P48052 419 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 AQP5P55064 265 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 LUZP2Q86TE4 346 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 KIF18BQ86Y91 864 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO27Q8NI29 283 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ITCHQ96J02 903 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 EBF4Q9BQW3 602 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 LAT2Q9GZY6 243 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PACSIN3Q9UKS6 424 aa21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FAM234BA2RU67 622 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TNFSF13O75888 250 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FCGR2AP12318 317 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 IL11P20809 199 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 KRTAP10-9P60411 292 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CBFBQ13951 182 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 MAPK14Q16539 360 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 FRRS1Q6ZNA5 592 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 LILRA2Q8N149 483 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF619Q8N2I2 560 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 OR10D3Q8NH80 312 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 OR2V1Q8NHB1 315 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 VPS33AQ96AX1 596 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEB18Q96M61 343 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PRRG4Q9BZD6 226 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 RNF122Q9H9V4 155 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A13Q9NSD5 602 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 LIPT1Q9Y234 373 aa21.54■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TNFSF11O14788 317 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMDEC1O15204 470 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 H6PDO95479 791 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ELK4P28324 431 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ADH6P28332 368 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SIRPAP78324 504 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CHRNEQ04844 493 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SKP2Q13309 424 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 SYPL1Q16563 259 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 COX20Q5RI15 118 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 PDSS1Q5T2R2 415 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ANKFN1Q8N957 763 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ZFP90Q8TF47 636 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ARSGQ96EG1 525 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRG7Q96K78 797 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.53■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0J9YW62 118 aa21.52■■□□□ 1.04
SMKR1-201ENST00000462322 CXCL13O43927 109 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms