RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SCDO00767 359 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RFXANKO14593 260 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC14L5O43304 696 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 STX11O75558 287 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF13O75888 250 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AQP8O94778 261 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RCBTB2O95199 551 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TGDSO95455 350 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 H6PDO95479 791 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 FOXF1Q12946 379 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 AGKQ53H12 422 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 EID3Q8N140 333 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MIER2Q8N344 545 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF614Q8N883 585 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 JKAMPQ9P055 326 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 VAPAQ9P0L0 249 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DUXAA6NLW8 204 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB2A8KAH6 182 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRKCAP17252 672 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1C1P21283 382 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 SELPLGQ14242 412 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GUSBP1Q15486 140 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB2Q16082 182 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO27Q8NI29 283 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.29□□□□□ -1.4
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